MethylAffinity™ Methylated DNA enrichment kit提供了一种以GCM™磁珠法从全基因组中快速富集甲基化DNA片段的方法。浓缩后的甲基化DNA片段可提高下游实验与分析的效果，例如RT-PCR、微阵列、测序等甲基化状态和定位研究的方法。
以基因工程方法获得的GCM重组蛋白是一种具有甲基结合功能域（MBD）的蛋白，可与含有甲基化CpG双核苷酸的双链DNA特异的结合，比野生型MBD具有更高的亲和性和特异性。
实验流程
产品优势
更少的步骤和更少的时间
- 整个实验过程不足2个小时
- 固定化的GCM™重组MBD蛋白，无需再进行填料-MBD的固定化反应
- 可结合双链CpG甲基化DNA，样品基因组DNA无需变性
- 可快速洗脱产物，无需蛋白酶处理
- 洗脱产物可立即用于RT-PCR等下游检测
高亲和力
- 亲和力高于其他商业化MBD蛋白
- 可富集分离仅有几个拷贝的甲基化CpG双核苷酸
- 可处理纳克级的基因组DNA
梯度洗脱
- 为精确研究甲基化状态，可结合NaCl梯度洗脱，GCM™-Bead能分离具有不同CpG位点密度的DNA片段
操作简便
- 具有鲜艳的红色，比传统的sepharose Bead更有效地避免清洗过程中的损失
- 试剂盒提供的限制性内切酶可用于基因组DNA的片段化
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| 图1. 100ng小鼠基因组DNA与5µlGCM™-Bead室温结合 1小时，经binding buffer 清洗4次，最后用Elution buffer 洗脱甲基化DNA。收集结合后上清物（Wash）及洗脱物（Elution）， 用小鼠β-acting Promoter primer（甲基化阴性对照）、小鼠 GAPDH Promoter primer（甲基化阴性对照）及小鼠IAP primer （甲基化阳性对照）进行PCR检测。β-acting Promoter primer 及GAPDH Promoter primer扩增带只出现在结合后上清物中， 而IAP primer的扩增带则出现在洗脱物中。 | 图2. 左边为sepharose，右边为GCM™-Bead。与传统的sepharose Bead相比较，GCM™-Bead更容易辨认，在清洗过程中有效避免损失。 |
