miProfile™ miRNA qPCR Arrays
复能基因提供各种miRNA表达差异定量检测阵列,包括miRNome、 cancer、 disease and focus-group等类型的miRNA检测阵列目录产品,同时也提供客户定制服务。
高通量miRNA表达差异定量检测阵列
MicroRNAs (miRNAs)是一种在转录水平调节基因表达的非编码小RNAs,长度通常在21-23个核苷酸之间。miRNAs在真核生物中高度保守并在细胞通路中起到重要的调节作用。miRNA调节基因的异常表达与癌症、心血管障碍等多种疾病有关。
miProfile™ miRNA qPCR Arrays主要用于对感兴趣组织或细胞中miRNA的表达量进行分析,从而发现与您研究相关的特异miRNAs。每块96孔板(或384孔板)包含84 条(或360条)已交联在反应孔中的PCR引物(正向:miRNA特异引物;反向:通用引物),同时包含12个(或24个)用于监控从反转录到qPCR反应的每个实验步骤效率的对照孔。
每条miRNA引物验证均产生单一扩增产物,融解曲线均呈单一锐锋,电泳条带均呈单一条带,且与目标miRNA相符。由10种人组织混合样本的总RNA经逆转录形成的cDNA作为引物验证的模板。
使用通用的实时定量反应条件,即可简便进行高通量的miRNA表达量检测和分析。逆转录试剂All-in-One™ miRNA First-Strand cDNA Synthesis Kit 和荧光染料SYBR® Green为基础的定量检测试剂All-in-One™ qPCR Mix Kit作为被推荐的RT-qPCR试剂与miProfile™ miRNA qPCR Array配套使用。该系列试剂均经过优化,具有高的灵敏度、效率和特异性。
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产品优势
验证引物:
每条miRNA引物均使用专利算法设计并经过实验确证
性能优越:
灵敏度高 – 能检测低至10 pg小RNA或20 pg总RNA中的miRNA
特异性高 – 能检测miRNAs单碱基差异,每条引物的扩增效率和特异性均经过实验验证
线性范围宽 – 能同时检测不同表达水平的miRNA
重复性好 – 批间和批内高重复性(R2>0.99)
覆盖范围广、目录产品与客户定制兼容:
最大可能覆盖全基因组miRNA
癌症miRNA组群目录产品
客户定制miRNA组群产品
图 1. miRNA PCR array 实验流程(左) 和 miRNA RT-qPCR反应原理(右)
性能数据
Linear Range and Sensitivity (Total RNA)
以梯度倍比稀释的人类结肠癌总RNA为模板,使用All-in-One™ miRNA qRT-PCR Detection Kit检测miR-21 和miR-1260表达量。横坐标为加入总RNA模板量的对数值,纵坐标为对应Ct值,实验数据表明,在20 pg到 2 µg总RNA的线性范围内,试剂盒具有较高的灵敏度。因此可用于多种miRNA表达量,甚至是低表达miRNA的检测。
Inter-Array Reproducibility
采用人类总RNA(10种组织混合物)作为样本,在Bio-Rad iQ5上对miRNA qPCR array (plate A和B)重复性进行分析。计算并比较重复板间的Ct值。结果显示批内重复性R2 > 0.99。同时,批间重复性也达R2 > 0.99(数据未显示)。
Single Nucleotide Mismatches
Hsa-miR-29a 和 has-miR-29c具有单碱基差异(B)All-in-One miRNA qRT-PCR Detection Kits可以区分单碱基差异的Hsa-miR-29a和Hsa-miR-29c。miRNA引物分别检测对应的miRNA模板(靶标序列)及单碱基差异的 miRNA模板(脱靶序列),相对分辨率表示脱靶检出量与靶标检出量的百分比(100% x 2 -△Ct)(A)